Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCD1P33897 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms