Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DSG3P32926 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSG3P32926 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSG3P32926 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSG3P32926 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DSG3P32926 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG3P32926 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG3P32926 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG3P32926 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG3P32926 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG3P32926 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DSG3P32926 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DSG3P32926 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DSG3P32926 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DSG3P32926 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DSG3P32926 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms