Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPS1P31327 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CPS1P31327 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CPS1P31327 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPS1P31327 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPS1P31327 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPS1P31327 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPS1P31327 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPS1P31327 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPS1P31327 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPS1P31327 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPS1P31327 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CPS1P31327 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPS1P31327 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPS1P31327 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CPS1P31327 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPS1P31327 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CPS1P31327 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPS1P31327 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms