Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA10P31260 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms