Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND3P30281 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND3P30281 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND3P30281 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND3P30281 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND3P30281 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND3P30281 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND3P30281 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND3P30281 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND3P30281 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND3P30281 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCND3P30281 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCND3P30281 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms