Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP1P29466 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP1P29466 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP1P29466 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP1P29466 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP1P29466 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP1P29466 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms