Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A5P29400 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms