Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RXRBP28702 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RXRBP28702 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RXRBP28702 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RXRBP28702 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRBP28702 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRBP28702 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRBP28702 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRBP28702 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRBP28702 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRBP28702 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRBP28702 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRBP28702 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRBP28702 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRBP28702 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RXRBP28702 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RXRBP28702 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RXRBP28702 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RXRBP28702 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRBP28702 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRBP28702 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRBP28702 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRBP28702 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRBP28702 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRBP28702 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRBP28702 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRBP28702 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRBP28702 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRBP28702 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms