Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTFRP26992 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms