Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMLP26374 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMLP26374 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMLP26374 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMLP26374 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMLP26374 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMLP26374 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMLP26374 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMLP26374 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms