Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMO2P25791 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMO2P25791 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LMO2P25791 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LMO2P25791 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LMO2P25791 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LMO2P25791 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMO2P25791 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO2P25791 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO2P25791 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO2P25791 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMO2P25791 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms