Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSSP25774 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSSP25774 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSSP25774 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSSP25774 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSSP25774 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSSP25774 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSSP25774 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSSP25774 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSSP25774 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSSP25774 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTSSP25774 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms