Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BCL3P20749 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCL3P20749 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BCL3P20749 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCL3P20749 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCL3P20749 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCL3P20749 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCL3P20749 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCL3P20749 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms