Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC3P19447 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms