Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCLP19338 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCLP19338 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCLP19338 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCLP19338 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCLP19338 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCLP19338 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms