Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPN1P18031 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN1P18031 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms