Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLT1P17948 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLT1P17948 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLT1P17948 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLT1P17948 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FLT1P17948 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
FLT1P17948 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLT1P17948 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms