Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYN1P17600 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYN1P17600 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYN1P17600 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYN1P17600 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYN1P17600 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYN1P17600 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYN1P17600 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms