Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF7P17544 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF7P17544 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF7P17544 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7P17544 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7P17544 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7P17544 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7P17544 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7P17544 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7P17544 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms