Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPD1P17405 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD1P17405 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms