Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB3P16520 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB3P16520 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB3P16520 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms