Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD44P16070 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD44P16070 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD44P16070 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD44P16070 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD44P16070 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD44P16070 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD44P16070 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD44P16070 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD44P16070 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD44P16070 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD44P16070 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD44P16070 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD44P16070 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD44P16070 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD44P16070 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD44P16070 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD44P16070 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD44P16070 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD44P16070 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD44P16070 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD44P16070 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD44P16070 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms