Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HLA-DOBP13765 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-DOBP13765 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms