Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA4P13612 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms