Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXD8P13378 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD8P13378 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms