Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEFA4P12838 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA4P12838 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms