Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1P11387 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1P11387 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1P11387 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1P11387 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1P11387 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms