Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRFP10586 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms