Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI4P10075 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI4P10075 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI4P10075 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI4P10075 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI4P10075 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI4P10075 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI4P10075 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GLI4P10075 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GLI4P10075 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GLI4P10075 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI4P10075 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms