Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC192P0DO97 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC192P0DO97 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms