Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBSLP0DN79 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBSLP0DN79 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms