Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD2P0DJD1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD2P0DJD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD2P0DJD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms