Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA6AP0CW24 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA6AP0CW24 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms