Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXB5P09067 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms