Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSP90AB1P08238 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms