Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAVP06756 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAVP06756 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms