Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA1P02708 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA1P02708 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms