Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGAP02671 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGAP02671 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGAP02671 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGAP02671 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FGAP02671 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGAP02671 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGAP02671 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGAP02671 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGAP02671 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms