Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GADD45BO75293 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GADD45BO75293 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms