Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG13O75143 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG13O75143 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG13O75143 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG13O75143 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG13O75143 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG13O75143 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG13O75143 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG13O75143 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG13O75143 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms