Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP9AO75110 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP9AO75110 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms