Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
KIAA0556O60303 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms