Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCA5O60264 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms