Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDIL3O43854 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDIL3O43854 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms