Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DENRO43583 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DENRO43583 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DENRO43583 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DENRO43583 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms