Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNJ1O43426 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ1O43426 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms