Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERI3O43414 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERI3O43414 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERI3O43414 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERI3O43414 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERI3O43414 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERI3O43414 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms