Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LRRTM2O43300 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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