Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC5O15511 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms