Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB6O15197 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms